莱茵城作为晶核中的重要探索区域，分布着多个隐藏宝箱供玩家发掘。这些宝箱的位置较为隐蔽，主要集中在下城区、黑街入口及相连的下水道系统内，总计数量为8个。玩家在自由探索模式下需仔细搜寻特定场景的角落、平台或特殊结构后方可发现。获取宝箱内的通行证等奖励对角色成长具有实际助益，因此掌握其确切位置至关重要。
第一个宝箱需前往黑街地图的二楼，即地图右上角一处狭长的小平台上，此处视野开阔但路径隐蔽。第二个宝箱则藏匿于地图中间偏左位置的楼梯后方，需绕至楼梯背面方能察觉。探索该区域时，需注意环境中的障碍物遮挡，部分宝箱可能被建筑结构或杂物掩盖。
猎羊队货舱连接的下水道-蓄水池区域是宝箱分布最密集之处，此处存在四个宝箱。玩家进入蓄水池地图后，可在地图中间偏下位置发现首个宝箱。第二个宝箱位于蓄水池墙上，同样处于中间偏下区域。第三个宝箱需进门后右转寻找。第四个宝箱则藏身于地图中间偏右的位置。该区域地形复杂，存在多个小房间及通道，宝箱可能放置于废弃水箱站台、铁栅栏附近，或堆积的货物、木箱后方，需留意角落及视觉死角。
最后一个宝箱位于下水道-排污口地图的中间位置。玩家需从蓄水池区域按特定路径进入排污口（通常需按顺序通过1号、2号通道）。抵达排污口后，需在区域尽头完成关闭四根水管的互动操作，宝箱才会显现。此步骤为触发宝箱出现的必要条件，若未完成操作则无法找到该宝箱。
