完成一周目后，咱们会回到真新镇的家中。这时候大木博士会主动来找你，如果之前已经收集了60种以上的宝可梦图鉴，他会帮忙升级到全国图鉴模式。这是开启二周目的关键步骤，别忘了提前多抓点宝可梦哦。
接下来需要去枯叶市码头坐船前往一之岛。在一之岛的精灵中心会遇到一位NPC，他提到机器需要红宝石才能修复。咱们得去灯火山找红宝石，路上会遇到火箭队的残党，击败他们后进入山洞深处就能拿到红宝石。记得带会碎岩和冲浪技能的宝可梦，这些技能在探索过程中非常有用。
拿到红宝石后回去交给NPC，他会告诉咱们还需要一块蓝宝石，同时给一张彩虹通行证，这样就能自由往返七岛了。接下来重点探索五岛和六岛，在五岛的火箭队仓库需要密码才能进入，而六岛的标记森林和变化洞窟藏着不少隐藏道具和宝可梦。蓝宝石就在六岛的洞穴里，但要注意跟踪的NPC会抢走它，得再去五岛的仓库抢回来。
最后把蓝宝石带回一之岛完成任务，就能解锁全岛通信功能。这时候可以挑战七岛的训练师塔，或者去华蓝洞窟捕捉超梦。二周目的宝可梦等级普遍较高，建议提前调整好队伍配置，带上足够的回复道具。整个过程中记得多存档，避免意外翻车。
